El origen de la localidad se remonta a finales del siglo IX o principios del X, aunque hay que suponer que con anterioridad estas tierras estuvieron ocupadas por autrigones y posteriormente por los romanos. Perteneció al Alfoz de Pancorbo y su nombre podría estar relacionado, según algunas hipótesis, con un lugar quemado (bustum). La localidad llegó a superar los 800 habitantes en 1950 y contó con dos centros educativos, uno de ellos de ámbito comarcal.

Del pasado de Busto quedan como principales vestigios la iglesia de San Martín, la ermita de la Virgen de Mediavilla y las ruinas del Monasterio de San Miguel, cuya construcción data de finales del siglo XI.